Водные биоресурсы находятся в ведении областного министерства по радиационной и экологической безопасности с 2010 года. В рамках своих полномочий за счет федеральных и областных средств специалистами министерства в этом направлении проводится регулярная работа по определению границ рыбопромысловых участков и по изучению запасов водных ресурсов, определению объемов их вылова, а также очистке водоемов от брошенных сетей и мусора. Увеличение объема финансирования позволит увеличить количество проводимых мерпориятий.

В 2013 году за счет федеральных субвенций будут определены границы для 30 новых рыбопромысловых участков, которые затем на конкурсной основе будут переданы в пользование для ведения рыбного хозяйства. Очищены от брошенных сетей и мусора озера Тургояк и Смолино, являющиеся памятниками природы. До конца года планируется очистить от мусора береговую линию еще нескольких озер.