Чаще всего проверяющие столкнулись с несоблюдением требований в области обращения с отходами, охраны атмосферного воздуха, водного законодательства, режима особо охраняемых природных территорий. Многие предприятия не ведут учета отходов, не имеют разрешений на выбросы загрязняющих веществ, допускают незаконные сбросы сточных вод в природные водоемы и т.д.
Наиболее значимыми результатами контрольно-надзорной деятельности ведомства в 2014 году стало предотвращение факта загрязнения навозом озера Тишки в Кунашакском районе, устранение незаконного слива бетона на территории городского бора, устранение сброса неочищенных стоков в озеро Теренкуль, а также начата реконструкция очистных сооружений канализации в поселке Жукатау Саткинского района.