С 6 июня авиарейсы на этом направлении увеличатся с трех до четырех раз в неделю, а с 9 июля – до пяти раз в неделю. Сейчас социальный тариф между Екатеринбургом и Магнитогорском составляет 500 рублей в одну сторону и 800 рублей за перелет «туда-обратно» без учета сборов. Утренние вылеты из Екатеринбурга в Магнитогорск выполняются по пятницам и воскресеньям, вечерние – по средам и пятницам. Из Магнитогорска в Екатеринбург утренний рейс - по четвергам, пятницам и воскресеньям, вечерний – по пятницам. С 9 июля так же будет введен ночной рейс с вылетом из Екатеринбурга в 23:20 по понедельникам, а из Магнитогорска в 1:25 по вторникам. Авиационный транзит через Кольцово свяжет Магнитогорск с 15-ю городами России и СНГ, такими как: Волгоград, Бишкек, Худжанд, Баку, Санкт-Петербург, Казань, Самара, Новосибирск, Томск, Иркутск, Сочи, Прага, Чита, Минводы, Ростов, Краснодар и Махачкала.
До конца 2012 года аэропортом планируется возобновить существовавший в годы советской власти регулярный авиарейс Челябинск-Магнитогорск. Окончательная стоимость перелета пока не известна.
