Василий Алексанян работал в «ЮКОСе» с 1996 года. В 2006 году стал исполнительным вице-президентом компании, а вскоре после этого был арестован и обвинен в финансовых преступлениях: его обвинили в хищении акций ОАО «Томскнефть» и имущества Восточной нефтяной компании, а также в отмывании денег. Алексанян оставался под стражей до декабря 2008 года, когда его отпустили под залог в 50 млн рублей. Уголовное дело против него было закрыто в 2010 году в связи с истечением срока давности. В конце 2006 года во время судебно-медицинской экспертизы выяснилось, что Алексанян ВИЧ-инфицирован. Об этом стало известно в январе 2008 года, когда о диагнозе подсудимого объявил представитель обвинения. За время заключения у Алексаняна были выявлены также рак и туберкулез. Кроме того, он практически ослеп. Адвокаты бывшего вице-президента «ЮКОСа» утверждали, что он не получает лечения, а сам Алексанян заявил, что его заставляют дать ложные показания против других руководителей в обмен на свободу.